3月21日上午,生物物理学学科在学院415会议室召开本学期第一次研究生学术研讨会。牛晓玉、李燕、王云杰三位同学分别汇报了个人科研工作进展,学科全体研究生及导师参会。
首先,牛晓玉同学基于网络药理学框架,针对肥胖合并糖尿病构建了“药物靶点-关键基因-核心通路-信号流模拟”的多层次分析体系。通过整合药物活性成分与疾病靶点的交互网络,锁定了关键的基因-药物调控轴,明确了其在特定信号通路中的富集特征,进一步利用药物信号流模拟动态解析了药物干预在生物网络中的传导路径与扰动效应。系统性地揭示了药物“多成分-多靶点-多通路”的协同调控机制,为肥胖合并糖尿病的药物筛选提供了可靠的候选依据与理论支撑。
随后,李燕同学以“心肌细胞分化过程中组蛋白修饰和可变剪接的调控机制”为题进行了汇报。汇报聚焦组蛋白修饰和可变剪接的调控机制,基于转录组数据和染色质免疫沉淀数据识别分化过程中的差异基因、组蛋白修饰信号以及可变剪接事件,利用转录起始位点或跳跃外显子侧翼区域组蛋白信号,采用六种机器学习对差异基因进行预测,得到了较为理想的结果。计算了三类SE事件中PSI和组蛋白修饰信号之间的相关性,并对SE侧翼区域的信号分布进行了可视化。此工作为心肌细胞分化过程中的组蛋白修饰和可变剪接的调控提供了新的数据分析思路,揭示了二者协同调控心肌细胞分化的内在关联,为深入解析心肌发育分子机制、探索心脏相关疾病的形成和治疗提供了线索。
最后,王云杰同学汇报了其研究的内容,通过Seurat整合单细胞RNA-seq数据完成质量控制、降维聚类及细胞类型鉴定,结合AUCell量化乳酸化水平、Monocle分析动态变化,CellChat揭示肿瘤与正常细胞通讯差异。聚焦肝细胞,整合10种机器学习算法构建乳酸化相关基因预后模型,经TCGA与GSE14520队列验证,通过生存分析、ROC曲线及列线图评估预后价值。
汇报完毕,师生们就三位同学现阶段的工作进行了讨论,导师们给出了指导意见,比如实验参数如何选取及优化、机器学习模型的参数调优方向等。此外,还特别针对数据分析环节提出了建议,强调要进一步挖掘数据背后的生物学意义,加强结果的统计学验证。本次研讨会不仅是现阶段三位研究生科研工作的总结,也为师生间的学术交流提供了一次很好的机会。


